RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PATE1Q8WXA2 126 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 EDAQ92838 391 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC115Q96NT0 180 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNC2Q96PR1 638 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 VCX3BQ9H321 246 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 UCK1Q9HA47 277 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SERHLQ9NQF3 203 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 VAPAQ9P0L0 249 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 AP4S1Q9Y587 144 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2A25A4D2G3 310 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DFNA5O60443 496 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SCN2BO60939 215 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 EPN2O95208 641 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GBAP04062 536 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 UMPSP11172 480 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DRD2P14416 443 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DDCP20711 480 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 BCKDHBP21953 392 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 IL10P22301 178 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SSR2P43308 183 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G16P53816 162 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SESN3P58005 492 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MTPNP58546 118 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MANEAQ5SRI9 462 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SPESP1Q6UW49 350 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD46Q86W74 232 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PAQR7Q86WK9 346 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL14Q8N4G2 192 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T12Q8NG77 320 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2L5Q8NG80 312 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC38A3Q99624 504 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KNL1Q8NG31 2342 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0J9YY10 115 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GTW7 788 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5K3A6NET4 321 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CLIC1O00299 241 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX19O60806 448 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR37L1O60883 481 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GSNP06396 782 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 C8BP07358 591 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 IL3P08700 152 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35G6P0C7Q6 338 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGP20916 626 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A1P30825 629 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 VHLP40337 213 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FASLGP48023 281 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FNTBP49356 437 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT3P56703 355 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KLC1Q07866 573 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE7AQ13946 482 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 LYSMD4Q5XG99 296 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GLYATQ6IB77 296 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 LCN8Q6JVE9 175 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ASPGQ86U10 573 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM126BQ8IUX1 230 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10A6Q8NH74 314 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF583Q96ND8 569 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 INPP5KQ9BT40 448 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms