RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR48Q8TAF3 677 aa20.1■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF480Q8WV37 535 aa20.1■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.1■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PLXNA2O75051 1894 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 MMP12P39900 470 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PRLHRP49683 370 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 GANABQ14697 944 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 ARMCX4Q5H9R4 360 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 STEAP3Q658P3 488 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 RNF130Q86XS8 419 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 AMER2Q8N7J2 671 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 CENPOQ9BU64 300 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 MS4A12Q9NXJ0 267 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 INSL6Q9Y581 213 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 TSPAN11A1L157 253 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 QSOX1O00391 747 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 SERPINB1P30740 379 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 TBPL1P62380 186 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PCDH1Q08174 1060 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 CARTPTQ16568 116 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 ERAP2Q6P179 960 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 FOPNLQ96NB1 174 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 COL21A1Q96P44 957 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.08■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 PRAMEF10O60809 474 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 FGF19O95750 216 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 CTNNB1P35222 781 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 DGKGP49619 791 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 CDK6Q00534 326 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 C2orf80Q0P641 193 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 MESP2Q0VG99 397 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 DHCR24Q15392 516 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 LACC1Q8IV20 430 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 POC5Q8NA72 575 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 PPCDCQ96CD2 204 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF556Q9HAH1 456 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.08■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 FURINP09958 794 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 NPPBP16860 134 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGP20916 626 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 RGS6P49758 472 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 PRSS53Q2L4Q9 553 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM180BQ6P0A1 224 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 C12orf40Q86WS4 652 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 DEPDC4Q8N2C3 294 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 Q96MT0 163 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 VPS35Q96QK1 796 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM129BQ96TA1 746 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 THSD1Q9NS62 852 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 ACER3Q9NUN7 267 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 RHCGQ9UBD6 479 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 GULP1Q9UBP9 304 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 H3BM21 787 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 TAF4O00268 1085 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF197O14709 1029 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 IRS1P35568 1242 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 DGKEP52429 567 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 TAS2R50P59544 299 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 LRRC74AQ0VAA2 488 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 STARD3Q14849 445 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 SPRED2Q7Z698 418 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 RAD9AQ99638 391 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 EHD1Q9H4M9 534 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.07■□□□□ 0.8
PTDSS2-201ENST00000308020 K7ESM1 405 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms