RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 EBPLQ9BY08 206 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 FANCEQ9HB96 536 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PRDM7Q9NQW5 492 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 KNTC1P50748 2209 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 HYKKA2RU49 373 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 FAM149AA5PLN7 773 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 MED26O95402 600 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 KLK1P06870 262 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 BCKDHAP12694 445 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ARFIP1P53367 373 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 BTN3A2P78410 334 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TGM3Q08188 693 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 GRM7Q14831 915 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 AAGABQ6PD74 315 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF793Q6ZN11 406 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ABHD13Q7L211 337 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 BMPERQ8N8U9 685 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 AMER3Q8N944 861 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 NRG4Q8WWG1 115 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 C10orf90Q96M02 699 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 STRADBQ9C0K7 418 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 LRCH1Q9Y2L9 728 aa16.88■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 H0Y3Z8 333 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PCDH7O60245 1069 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 MYO1DO94832 1006 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 KLHL18O94889 574 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ADRB1P08588 477 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CCL4P13236 92 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ALOX12P18054 663 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SSR2P43308 183 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 DEFB134Q4QY38 66 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 C6orf163Q5TEZ5 329 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PRSS41Q7RTY9 318 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 GPR135Q8IZ08 494 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 OR8K5Q8NH50 307 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 STMN2Q93045 179 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 QRFPRQ96P65 431 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 AIG1Q9NVV5 245 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ASIC5Q9NY37 505 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 GPR45Q9Y5Y3 372 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SLC22A7Q9Y694 548 aa16.87■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 FKBP6O75344 327 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CIB2O75838 187 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 G6PDP11413 515 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 IDO1P14902 403 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ACPPP15309 386 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SDC1P18827 310 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SPINK2P20155 84 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TACR1P25103 407 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 MAPK1P28482 360 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 EMP3P54852 163 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 NUDT13Q86X67 352 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PDSS2Q86YH6 399 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 LIX1Q8N485 282 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ACOT4Q8N9L9 421 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CMKLR1Q99788 373 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF385DQ9H6B1 395 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 APMAPQ9HDC9 416 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ADAM29Q9UKF5 820 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 RARRES3Q9UL19 164 aa16.86■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 A0A0A6YYD5 115 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 IL1RNP18510 177 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CERS1P27544 350 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 GCGRP47871 477 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 MC2RQ01718 297 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 HERC3Q15034 1050 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 GSTA3Q16772 222 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 NDUFA9Q16795 377 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PGM2L1Q6PCE3 622 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CYP20A1Q6UW02 462 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms