RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 CHTF18Q8WVB6 975 aa25.91■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 VPS35Q96QK1 796 aa25.91■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 ZIC5Q96T25 663 aa25.91■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 CDCA4Q9BXL8 241 aa25.91■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 HHATLQ9HCP6 504 aa25.91■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.91■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 TNFRSF21O75509 655 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 C6orf47O95873 294 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 PRIM2P49643 509 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 RPS13P62277 151 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 TBRG1Q3YBR2 411 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 C19orf48Q6RUI8 117 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 ASZ1Q8WWH4 475 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 SLC35A5Q9BS91 424 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 V9GYH0 126 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 SGTAO43765 313 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 CHMP24386 653 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 MXD1Q05195 221 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF33BQ06732 778 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF79Q15937 498 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 KLHL17Q6TDP4 642 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 TMCO6Q96DC7 493 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 DEPDC7Q96QD5 511 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 PHOX2BQ99453 314 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 BEX2Q9BXY8 128 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 DYRK4Q9NR20 520 aa25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 CENPXA8MT69 81 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 GASTP01350 101 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 TIE1P35590 1138 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 MC1RQ01726 317 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 GCNT6Q5T4J0 391 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 PLAG1Q6DJT9 500 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 CAMKMTQ7Z624 323 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 GALNT12Q8IXK2 581 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM246Q9BRR3 403 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 STARD7Q9NQZ5 370 aa25.89■■□□□ 1.74
FAM149A-201ENST00000227065 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 HNF4AP41235 474 aa25.89■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 TRIM60Q495X7 471 aa25.89■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 TAPBPLQ9BX59 468 aa25.89■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 PPIL1Q9Y3C6 166 aa25.89■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 GADD45GO95257 159 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 BDKRB1P46663 353 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 PREPP48147 710 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 RAB43Q86YS6 212 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 RERGLQ9H628 205 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 BRF2Q9HAW0 419 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 NPAP1Q9NZP6 1156 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PQY0 241 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 SAP18O00422 153 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 ENTPD6O75354 484 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 SOX14O95416 240 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 CD72P21854 359 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 GPR162Q16538 588 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 FAM180BQ6P0A1 224 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 CRIPAKQ8N1N5 446 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 SNX18Q96RF0 628 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.88■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PQ09 198 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 SLC16A8O95907 504 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 GSTM1P09488 218 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 CYP4F8P98187 520 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 KCNC3Q14003 757 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 UBE2J2Q8N2K1 259 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 CLN6Q9NWW5 311 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 RAB23Q9ULC3 237 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 KPNA5O15131 536 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 CCL23P55773 120 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 C22orf39Q6P5X5 142 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 SLC34A3Q8N130 599 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 CHST14Q8NCH0 376 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 FLCNQ8NFG4 579 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 FIBINQ8TAL6 211 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 RNF186Q9NXI6 227 aa25.87■■□□□ 1.73
FAM149A-201ENST00000227065 FTSJ1Q9UET6 329 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms