RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000099241.3

Ccl28-201, Transcript of C-C motif chemokine 28, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl28, Length 3,740 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ccdc107Q9DCC3 242 aa5.7□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Cldn9Q9Z0S7 217 aa5.7□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa5.7□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Sppl2cA2A6C4 690 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Tmem236A2ARJ3 344 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ttll3A4Q9E5 927 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Vmn2r4K7N784 913 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ackr2O08707 378 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Slc22a8O88909 537 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Cdk1P11440 297 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Abcb1aP21447 1276 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Htr1bP28334 386 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 GlrbP48168 496 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Serpind1P49182 478 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Hoxb13P70321 286 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Yes1Q04736 541 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pnpla1Q3V1D5 599 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Fam189bQ5HZJ5 669 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Nup62Q63850 526 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Cxcl3Q6W5C0 100 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Olfr1307Q7TQX1 312 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Olfr598Q7TRR2 319 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Zadh2Q8BGC4 377 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Slc7a6Q8BGK6 515 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 AntxrlQ8BVM2 641 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Mfsd6Q8CBH5 775 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pdlim5Q8CI51 591 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Cbx7Q8VDS3 158 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Adgrf1Q8VEC3 908 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Psat1Q99K85 370 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Slc24a3Q99PD7 645 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Arhgap8Q9CXP4 425 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Efhc2Q9D485 750 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Lpar2Q9JL06 348 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 RhoaQ9QUI0 193 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Mapk11Q9WUI1 364 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Dock1Q8BUR4 1865 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Plin4O88492 1403 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Mrgpra2aA0A0R4J1Z0 331 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Olfr485A0A140LJF5 317 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Skint9A7TZG3 319 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Lrr1D3YY91 422 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gm8369E9PZI3 166 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Olfr172E9Q8F6 309 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 TspearJ3S6Y1 670 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Vmn2r8L7N472 848 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Slc6a2O55192 617 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Bmp6P20722 510 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 ThP24529 498 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Rpl3P27659 403 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Hoxd10P28359 340 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 FshrP35378 692 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 OstnP61364 130 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ap2s1P62743 142 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Elmod1Q3V1U8 326 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 H2-Q2Q4KN81 360 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 ClpbQ60649 677 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ppp3r1Q63810 170 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gba2Q69ZF3 918 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Polr2mQ6P6I6 366 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Znf503Q7TMA2 652 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Chil6Q80W26 440 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Itln1bQ80ZA0 313 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Lix1lQ8BQ89 337 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 B4gat1Q8BWP8 415 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Bpifb2Q8C1E1 462 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pih1d2Q8CHR9 315 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Fam83aQ8K2P2 436 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Oas1gQ8K469 367 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Vmn1r30Q8R2D2 302 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Tspan33Q8R3S2 283 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ppp1r14cQ8R4S0 164 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Olfr444Q8VFS6 310 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pcdhga9Q91XX9 932 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Klk6Q91Y82 253 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pskh1Q91YA2 424 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Zswim2Q9D9X6 631 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Q9DAY5 185 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Aph1cQ9DCZ9 258 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Vps29Q9QZ88 182 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Fzd9Q9R216 592 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Epm2aQ9WUA5 330 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Srd5a3Q9WUP4 330 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Ralgps1A2AR50 585 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Xlr5bA2BI50 236 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Pex10B1AUE5 324 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Zfp40B1B1D3 796 aa5.69□□□□□ -1.5
Ccl28-201ENSMUST00000099241 Gm43720E0CXM8 267 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.1 ms