RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641106.1

CASC19-211, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,184 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-211ENST00000641106 CD96P40200 585 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 OR1D4P47884 311 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TTPAP49638 278 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 PMS2P11Q13670 270 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 KCNJ11Q14654 390 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TMED2Q15363 201 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TTC27Q6P3X3 843 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 IQCKQ8N0W5 287 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 PRELID2Q8N945 189 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CCDC89Q8N998 374 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 NUP43Q8NFH3 380 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CALML6Q8TD86 181 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 FAM136AQ96C01 138 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 SLC35A4Q96G79 324 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 IP6K3Q96PC2 410 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 PANX3Q96QZ0 392 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 IL22Q9GZX6 179 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 WDR54Q9H977 334 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 A0A0J9YVX5 310 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TARM1B6A8C7 271 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 J3KRW8 73 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ACOT7O00154 380 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 PEX12O00623 359 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 FFAR3O14843 346 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 GPR42O15529 346 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 FGGP02679 453 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 RPN2P04844 631 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TPSB2P20231 275 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ATP5DP30049 168 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 FMO4P31512 558 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CXCR5P32302 372 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 MAGEA6P43360 314 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 NPY2RP49146 381 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TERF1P54274 439 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ARSFP54793 590 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CCZ1BP86790 482 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 KLC1Q07866 573 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 GRM7Q14831 915 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 RPS6KA1Q15418 735 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TPSAB1Q15661 275 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CYP2A13Q16696 494 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 BICRALQ6AI39 1079 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 PAQR7Q86WK9 346 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 LRRC6Q86X45 466 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-211ENST00000641106 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms