RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627441.2

SPTAN1-212, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-212ENST00000627441 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 A0A1W2PNV4 684 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 A0A1W2PP18 115 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 C3orf80F5H4A9 247 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 TRIM77I1YAP6 450 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 MSTNO14793 375 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 HAT1O14929 419 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 B3GALT4O96024 378 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 RALBP11234 206 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 PPP2R1BP30154 601 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 FMO4P31512 558 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 BDKRB1P46663 353 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 DIO3P55073 304 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 HILS1P60008 231 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 KCNJ2P63252 427 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 MAMLD1Q13495 774 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 KCTD11Q693B1 232 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 RTL4Q6ZR62 310 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 KIAA1328Q86T90 577 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 GPSM1Q86YR5 675 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 FAM168AQ92567 244 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 NCLNQ969V3 563 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC30A3Q99726 388 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 ESM1Q9NQ30 184 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 RMND1Q9NWS8 449 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.35□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 C16orf97H3BN30 126 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 CLOCKO15516 846 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 VPS26AO75436 327 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 FKBP9O95302 570 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 GNA14O95837 355 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 P04436 131 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 GDF1P27539 372 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 PTPN6P29350 595 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 GPR143P51810 404 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 ARFIP2P53365 341 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 KIF5AQ12840 1032 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 C8orf34Q49A92 452 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF425Q6IV72 752 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 CLEC17AQ6ZS10 378 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF677Q86XU0 584 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 CCNYQ8ND76 341 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 FAM71BQ8TC56 605 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 FBF1Q8TES7 1133 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 TRABDQ9H4I3 376 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.34□□□□□ -1.23
SPTAN1-212ENST00000627441 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 VWC2LB2RUY7 222 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 KDM1AO60341 852 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 RNF8O76064 485 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 MYO1DO94832 1006 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 ACSL3O95573 720 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 FTCDO95954 541 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 FHP07954 510 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 UCHL3P15374 230 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 ACRV1P26436 265 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 HK2P52789 917 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-212ENST00000627441 WNT3AP56704 352 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms