RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PGAM1	P18669	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	MSX1	P28360	303 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	AHR	P35869	848 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	AP1S2	P56377	157 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SKP1	P63208	163 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SBSN	Q6UWP8	590 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	EID3	Q8N140	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NRGN	Q92686	78 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM10	Q96HG1	83 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFAT	Q9P243	1243 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0G2JN53	185 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NRDC	O43847	1150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	DIAPH2	O60879	1101 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE9A	O76083	593 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC175	P0C221	793 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H2AD	P20671	130 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR143	P51810	404 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CSHL1	Q14406	222 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	MSS51	Q4VC12	460 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM58	Q8NG06	486 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NCLN	Q969V3	563 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNB4	P30926	498 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CLCN2	P51788	898 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP107	P57740	925 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	IL2	P60568	153 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TERF2	Q15554	542 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM156	Q8N614	296 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ASB5	Q8WWX0	329 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	VMP1	Q96GC9	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PELI2	Q9HAT8	420 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM166B	A8MTA8	275 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338		G3V3Y1	287 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC7	O00311	574 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2J2	O76002	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6B1	O95007	311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBB4A	P04350	444 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINA6	P08185	405 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SSR4	P51571	173 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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