RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	SMIM10	Q96HG1	83 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	UCK2	Q9BZX2	261 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	DEPP	Q9NTK1	212 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	RNF6	Q9Y252	685 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909		A0A0G2JN53	185 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PINLYP	A6NC86	204 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	NRDC	O43847	1150 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PPP2R1B	P30154	601 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	CLCN2	P51788	898 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	EMC4	Q5J8M3	183 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM156	Q8N614	296 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	GPATCH11	Q8N954	259 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	ASB5	Q8WWX0	329 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	ATL1	Q8WXF7	558 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	NCLN	Q969V3	563 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PELI2	Q9HAT8	420 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909		A0A0G2JMM0	328 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909		A0A1W2PPB8	328 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909		A0A1W2PRS3	328 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	URAD	A6NGE7	173 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TOX	O94900	526 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	SERPINA6	P08185	405 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	MSX1	P28360	303 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	CHRNB4	P30926	498 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	GPR143	P51810	404 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	BTN3A2	P78410	334 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	RUNX2	Q13950	521 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	GALNT7	Q86SF2	657 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TRPV3	Q8NET8	790 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	RND1	Q92730	232 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	CERS2	Q96G23	380 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	VMP1	Q96GC9	406 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	FAM166B	A8MTA8	275 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	CDC7	O00311	574 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	DIAPH2	O60879	1101 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TTC4	O95801	387 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TUBB4A	P04350	444 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	SSR4	P51571	173 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	NUP107	P57740	925 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	PMPCA	Q10713	525 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	TERF2	Q15554	542 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	XKR6	Q5GH73	641 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPS5-208	ENST00000599909	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74

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