RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	B4GALT2	O60909	372 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ICAM2	P13598	275 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	NSDHL	Q15738	373 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	LIPJ	Q5W064	366 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	SLC6A19	Q695T7	634 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	LCA5	Q86VQ0	697 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	OR7G3	Q8NG95	312 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	TSLP	Q969D9	159 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	IPPK	Q9H8X2	491 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	MAST4	O15021	2626 aa		18.89	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	E2F3	O00716	465 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	UGDH	O60701	494 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	UQCRH	P07919	91 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	QRFPR	Q96P65	431 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	KCNC2	Q96PR1	638 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	F2RL3	Q96RI0	385 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	SERINC2	Q96SA4	455 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	MS4A8	Q9BY19	250 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	TBK1	Q9UHD2	729 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	MED13	Q9UHV7	2174 aa		18.88	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	TTLL8	A6PVC2	850 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PRMT3	O60678	531 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	CELA2A	P08217	269 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	CD97	P48960	835 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	MTTP	P55157	894 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	RUNX2	Q13950	521 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	SFT2D3	Q587I9	215 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	CHSY3	Q70JA7	882 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	REPS1	Q96D71	796 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PPCS	Q9HAB8	311 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	LUZP4	Q9P127	313 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		18.87	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	FAM227A	F5H4B4	570 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	WISP1	O95388	367 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	TGFB1	P01137	390 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	SHBG	P04278	402 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	CERS1	P27544	350 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PIK3CB	P42338	1070 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	MLLT10	P55197	1068 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	RAB38	P57729	211 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	OR4D2	P58180	307 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PHEX	P78562	749 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	MFAP5	Q13361	173 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	BTBD16	Q32M84	506 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	LMF1	Q96S06	567 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	LPAR4	Q99677	370 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	PCTP	Q9UKL6	214 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		18.86	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469		A8MT66	165 aa		18.85	■□□□□ 0.61
PSME3-209	ENST00000589469	ESPN	B1AK53	854 aa		18.85	■□□□□ 0.61

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