RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580206.1

ANKRD30B-204, Transcript of ankyrin repeat domain 30B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKRD30B, Length 3,429 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD30B-204ENST00000580206 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
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ANKRD30B-204ENST00000580206 ZNF547Q8IVP9 402 aa12.86□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 CCL4L1Q8NHW4 92 aa12.86□□□□□ -0.35
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ANKRD30B-204ENST00000580206 ENTPD4Q9Y227 616 aa12.86□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 WDR37Q9Y2I8 494 aa12.86□□□□□ -0.35
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ANKRD30B-204ENST00000580206 AVPR1BP47901 424 aa12.86□□□□□ -0.35
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ANKRD30B-204ENST00000580206 RPP38P78345 283 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 BTN3A2P78410 334 aa12.86□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 KLHL17Q6TDP4 642 aa12.86□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 DMRT3Q9NQL9 472 aa12.86□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.86□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 SLC5A10A0PJK1 596 aa12.85□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 MATN1P21941 496 aa12.85□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 NUP107P57740 925 aa12.85□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 LSAMPQ13449 338 aa12.85□□□□□ -0.35
ANKRD30B-204ENST00000580206 IRF4Q15306 451 aa12.85□□□□□ -0.35
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