RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYL2P10916 166 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IMPDH1P20839 514 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCL11P51671 97 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 APOPT1Q96IL0 206 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDK15Q96Q40 435 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 F2RL3Q96RI0 385 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SERINC2Q96SA4 455 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RBCK1Q9BYM8 510 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LANCL2Q9NS86 450 aa20.93■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A0G2JN53 185 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 G3V2L1 256 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 B3GALT2O43825 422 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERLIN1O75477 346 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HPP00738 406 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TGFB1P01137 390 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTTPP55157 894 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDH13P55290 713 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLCQ05315 142 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF844Q08AG5 666 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT71Q3SY84 523 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UNC50Q53HI1 259 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM205Q6UW68 189 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SHISA5Q8N114 240 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CA13Q8N1Q1 262 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CENPKQ9BS16 269 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPT2Q9UMR5 302 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.92■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC151A5D8V7 595 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAJB6O75190 326 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EFNA3P52797 238 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NAA20P61599 178 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC63Q8NA47 563 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C8orf44Q96CB5 159 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF382Q96SR6 550 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.91■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAGEB17A8MXT2 336 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLHL41O60662 606 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCELO95171 688 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MLYCDO95822 493 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRB1P04280 392 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COX6A1P12074 109 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CERS1P27544 350 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSFMP43897 325 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARFIP1P53367 373 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOX8P57073 446 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RHAGQ02094 409 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FRG2Q64ET8 278 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GALNT16Q8N428 558 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BANPQ8N9N5 519 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLPP5Q8NEB5 264 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FRG2BQ96QU4 278 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR51B5Q9H339 312 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDM7Q9NQW5 492 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPR83Q9NYM4 423 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SENP1Q9P0U3 644 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MED13Q9UHV7 2174 aa20.9■□□□□ 0.94
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSPAN8P19075 237 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SSR2P43308 183 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAP1GDS1P52306 607 aa20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms