RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562425.1

PKD1-226, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 608 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-226ENST00000562425 LRRK2Q5S007 2527 aa15.5■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 B3GALT2O43825 422 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 DLX3O60479 287 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ALOX12BO75342 701 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ERLIN1O75477 346 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 DNAJB5O75953 348 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 RNH1P13489 461 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 IMPDH1P20839 514 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 PLA2G16P53816 162 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 MTTPP55157 894 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 NAA20P61599 178 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 RCN2Q14257 317 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 TMEM151BQ8IW70 566 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 RDH11Q8TC12 318 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 KCNC2Q96PR1 638 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 F2RL3Q96RI0 385 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 TMEM109Q9BVC6 243 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 MS4A8Q9BY19 250 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 MID2Q9UJV3 735 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 STK38LQ9Y2H1 464 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 RNF11Q9Y3C5 154 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.49■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 OR7A17O14581 309 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 SUV39H1O43463 412 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 JRKO75564 520 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 CEACAM4O75871 244 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 SUPT7LO94864 414 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 HPP00738 406 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 TGFB1P01137 390 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 FHP07954 510 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 MYL2P10916 166 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 PRKAA2P54646 552 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 SOX8P57073 446 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 OLR1P78380 273 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 SLC18A2Q05940 514 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 CROCCP2Q86T23 111 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 GALNT16Q8N428 558 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 CCDC63Q8NA47 563 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 SERINC2Q96SA4 455 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 AICDAQ9GZX7 198 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 GPR83Q9NYM4 423 aa15.48■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 NBASA2RRP1 2371 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 A0A1W2PQ72 361 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 A6NL46 340 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 B3GALT4O96024 378 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 PROCP04070 461 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ALPPP05187 535 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 PGDP52209 483 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 RAP1GDS1P52306 607 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ARFIP1P53367 373 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 CDH13P55290 713 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 AP2B1P63010 937 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 CLCQ05315 142 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 IFT88Q13099 833 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 DEPDC1Q5TB30 811 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 FRG2Q64ET8 278 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 FAAH2Q6GMR7 532 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 TMEM205Q6UW68 189 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 ZYG11AQ6WRX3 759 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 TRABD2AQ86V40 505 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 HPS6Q86YV9 775 aa15.47■□□□□ 0.07
PKD1-226ENST00000562425 C4orf33Q8N1A6 199 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms