RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 ACAT2Q9BWD1 397 aa13.05□□□□□ -0.32
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CS-231ENST00000552222 PCBD2Q9H0N5 130 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
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CS-231ENST00000552222 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 TRAV17A0A0B4J275 112 aa13.04□□□□□ -0.32
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CS-231ENST00000552222 SUPT3HB4E1H0 165 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 TARM1B6A8C7 271 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 MAP2K7O14733 419 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 KLK8O60259 260 aa13.04□□□□□ -0.32
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CS-231ENST00000552222 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 ICE2Q659A1 982 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 TMEM198Q66K66 360 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 MTFR2Q6P444 385 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 LCTLQ6UWM7 567 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 SHISA5Q8N114 240 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 C4orf33Q8N1A6 199 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 EXT2Q93063 718 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 SDCCAG3Q96C92 435 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 PGM2Q96G03 612 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 SCYL1Q96KG9 808 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 OR4K3Q96R72 315 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 C17orf62Q9BQA9 187 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 MKS1Q9NXB0 559 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 XPR1Q9UBH6 696 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 ADAM10O14672 748 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 GLRA3O75311 464 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 CCNDBP1O95273 360 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 S100BP04271 92 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 PRR35P0CG20 571 aa13.03□□□□□ -0.32
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CS-231ENST00000552222 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 BANPQ8N9N5 519 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 UBTD2Q8WUN7 234 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 ZUFSPQ96AP4 578 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 HAUS8Q9BT25 410 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 ABCF3Q9NUQ8 709 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 WWOXQ9NZC7 414 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 SENP1Q9P0U3 644 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 EMCNQ9ULC0 261 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-231ENST00000552222 OR2A25A4D2G3 310 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 NPIPA5E9PKD4 350 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 COPEO14579 308 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 MAP3K7O43318 606 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 NRP2O60462 931 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 STK16O75716 305 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 ITGAMP11215 1152 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 GFAPP14136 432 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 AGAP20933 346 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 HRH2P25021 359 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 GDF5P43026 501 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 CCT5P48643 541 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 HSPA7P48741 367 aa13.02□□□□□ -0.33
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CS-231ENST00000552222 KLC1Q07866 573 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 NAA25Q14CX7 972 aa13.02□□□□□ -0.33
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CS-231ENST00000552222 PFKFB4Q16877 469 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 FBXO48Q5FWF7 155 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 FCRLBQ6BAA4 426 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 ZNF425Q6IV72 752 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 HDXQ7Z353 690 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-231ENST00000552222 FGD2Q7Z6J4 655 aa13.02□□□□□ -0.33
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