RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CA7	P43166	264 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	MLF1	P58340	268 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	OR4D1	Q15615	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GPSM1	Q86YR5	675 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SLC34A3	Q8N130	599 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	KRT78	Q8N1N4	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ESAM	Q96AP7	390 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CLGN	O14967	610 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CLEC3A	O75596	197 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GSTA2	P09210	222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	STMN1	P16949	149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GSTM2	P28161	218 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GP5	P40197	560 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	KCNC1	P48547	511 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	HSPA7	P48741	367 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	RAB38	P57729	211 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	RBPJ	Q06330	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PDPR	Q8NCN5	879 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CCT6B	Q92526	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	FAR2	Q96K12	515 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GPR137	Q96N19	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	WWOX	Q9NZC7	414 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CCL21	O00585	134 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	STK16	O75716	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	FAM155B	O75949	473 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GMPR	P36959	345 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GPR143	P51810	404 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	RAB10	P61026	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	DOC2A	Q14183	400 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TRADD	Q15628	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	OR2L5	Q8NG80	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CD274	Q9NZQ7	290 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PRSS44	E7EML9	344 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	NME2P1	O60361	137 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	SLC19A2	O60779	497 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-229	ENST00000551936	EPOR	P19235	508 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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