RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551327.5

PXN-218, Transcript of paxillin, humanhuman

TSL 4

Gene PXN, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXN-218ENST00000551327 MAGEA4P43358 317 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 GLRBP48167 497 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 KCNC1P48547 511 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 PIK3CGP48736 1102 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 GPR143P51810 404 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 EFNA3P52797 238 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 TERF1P54274 439 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SLC26A5P58743 744 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 TAS2R50P59544 299 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 GPX6P59796 221 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 KRTAP10-9P60411 292 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ABRAXAS2Q15018 415 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ACAP2Q15057 778 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 CDSNQ15517 529 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 LIPJQ5W064 366 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 PLD3Q8IV08 490 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 HOMEZQ8IX15 550 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SHISA5Q8N114 240 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 MDS2Q8NDY4 140 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 GRHL3Q8TE85 626 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 PYCR2Q96C36 320 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 C8orf44Q96CB5 159 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 CFAP36Q96G28 342 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 KCNC2Q96PR1 638 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SERINC2Q96SA4 455 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 CD244Q9BZW8 370 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 OLAHQ9NV23 265 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ACANP16112 2415 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 NCKAP5O14513 1909 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.25□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SPG11Q96JI7 2443 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SAGE2PA6NJ88 616 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SGK494L7N484 410 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 CLGNO14967 610 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 TAPBPO15533 448 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ZNHIT1O43257 154 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 LRRTM2O43300 516 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 CTNSO60931 367 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 GUCA1CO95843 209 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 WDPCPO95876 746 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ITGAMP11215 1152 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 PYGBP11216 843 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SSTR1P30872 391 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 GALNSP34059 522 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 HNF4AP41235 474 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 KCNK10P57789 538 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 SERTAD2Q14140 314 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 43.4
PXN-218ENST00000551327 PDK4Q16654 411 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 BTBD16Q32M84 506 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 DEFB134Q4QY38 66 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 MNS1Q8NEH6 495 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 FAR2Q96K12 515 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 QRFPRQ96P65 431 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 PHF12Q96QT6 1004 aa8.24□□□□□ -1.09
PXN-218ENST00000551327 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms