RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550261.5

PPP1CC-205, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 5

Gene PPP1CC, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-205	ENST00000550261	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	KRT14	P02533	472 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	CSF2	P04141	144 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	POLB	P06746	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ALPI	P09923	528 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ALPPL2	P10696	532 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	VCL	P18206	1134 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	IVD	P26440	423 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	PSMB4	P28070	264 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	GRK5	P34947	590 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SPAM1	P38567	509 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	NSG1	P42857	185 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	LMAN1	P49257	510 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	TTPA	P49638	278 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ARL4C	P56559	192 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	MAX	P61244	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	CACNG1	Q06432	222 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	RALGDS	Q12967	914 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	RPA4	Q13156	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	NFATC2	Q13469	925 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	NAB1	Q13506	487 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ELOC	Q15369	112 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	PARG	Q86W56	976 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	EID2B	Q96D98	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	NUS1	Q96E22	293 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	COX14	Q96I36	57 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM170A	A1A519	330 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261		H3BNX3	289 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	CHUK	O15111	745 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	SCAMP1	O15126	338 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PPP1CC-205	ENST00000550261	FLRT2	O43155	660 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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