RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PROX1	Q92786	737 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	DHX58	Q96C10	678 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	EBF2	Q9HAK2	575 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089		Q9N2K0	584 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL1	Q9NR64	748 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	RGS18	Q9NS28	235 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SPG21	Q9NZD8	308 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	REV3L	O60673	3130 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089		A0A0D9SFI3	127 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	C5orf60	A6NFR6	353 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CAPN9	O14815	690 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	MAGEB2	O15479	319 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	INSIG1	O15503	277 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CAVIN2	O95810	425 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	IRF2	P14316	349 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ADRA2C	P18825	462 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJB1	P25685	340 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	MARK3	P27448	753 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TNFRSF8	P28908	595 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF132	P52740	706 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	NAGLU	P54802	743 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SP4	Q02446	784 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ANGPT1	Q15389	498 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TAZ	Q16635	292 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SMU1	Q2TAY7	513 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CASC4	Q6P4E1	433 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CORO2A	Q92828	525 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CD101	Q93033	1021 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	POMK	Q9H5K3	350 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	MTRR	Q9UBK8	725 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CEP250	Q9BV73	2442 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PPI3	338 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PS18	150 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089		A4D1N5	150 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF263	O14978	683 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CTSV	O60911	334 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	LRP3	O75074	770 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	WDPCP	O95876	746 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	GSR	P00390	522 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	NR3C1	P04150	777 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CSN3	P07498	182 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	SPP1	P10451	314 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	ATP6V1B1	P15313	513 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	TCF4	P15884	667 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	CA8	P35219	290 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	PTGER4	P35408	488 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	DLK1	P80370	383 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	GAGE5	Q13069	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	GAGE6	Q13070	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	RCN2	Q14257	317 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MDM2-223	ENST00000536089	KIR2DS3	Q14952	304 aa		3.78	□□□□□ -1.8

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