RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 UNC50Q53HI1 259 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 XKR7Q5GH72 579 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SIRPB2Q5JXA9 342 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CDKL4Q5MAI5 379 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 C1QL3Q5VWW1 255 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TTC23Q5W5X9 447 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 Q6ZRM9 215 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CHST9Q7L1S5 443 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SPRED1Q7Z699 444 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SCD5Q86SK9 330 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 DDIASQ8IXT1 998 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SVOPLQ8N434 492 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM199Q8N511 208 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 DHRSXQ8N5I4 330 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 OR8J3Q8NGG0 315 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 KCNJ9Q92806 393 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 FBXO32Q969P5 355 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 LRRC58Q96CX6 371 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PHF21BQ96EK2 531 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SGF29Q96ES7 293 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 HMCESQ96FZ2 354 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PPP3R2Q96LZ3 170 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CCDC115Q96NT0 180 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PSKH2Q96QS6 385 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZBTB18Q99592 522 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 OLFM1Q99784 485 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CIB1Q99828 191 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MGME1Q9BQP7 344 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TEX101Q9BY14 249 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NACA2Q9H009 215 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 HIPK3Q9H422 1215 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 OLAHQ9NV23 265 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 AIG1Q9NVV5 245 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF639Q9UID6 485 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PADI3Q9ULW8 664 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF711Q9Y462 761 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.55□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ILVBLA1L0T0 632 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 A1L4Q6 167 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NEMP2A6NFY4 417 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 FXYD1O00168 92 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 NME4O00746 187 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 KIAA0355O15063 1070 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ARPC2O15144 300 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CLOCKO15516 846 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 FOXS1O43638 330 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 DOK2O60496 412 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PFDN1O60925 122 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CBFA2T3O75081 653 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 ZFPL1O95159 310 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 OTCP00480 354 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 GOT2P00505 430 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CHRNA1P02708 482 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CFIP05156 583 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 MMP2P08253 660 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CSF1P09603 554 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CDH1P12830 882 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 PPP3CBP16298 524 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 KCNA5P22460 613 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 JAK1P23458 1154 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 OR1E1P30953 314 aa4.54□□□□□ -1.68
CYCSP28-201ENST00000534284 CCR10P46092 362 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms