RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 PRSS41Q7RTY9 318 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 PDSS2Q86YH6 399 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 KIRREL3Q8IZU9 778 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR51Q1Q8NH59 317 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 FKBP10Q96AY3 582 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SERINC2Q96SA4 455 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 AICDAQ9GZX7 198 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 PFDN4Q9NQP4 134 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC22A11Q9NSA0 550 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 THAP1Q9NVV9 213 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC12A4Q9UP95 1085 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 PADI2Q9Y2J8 665 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 FIS1Q9Y3D6 152 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.65□□□□□ -0.7
TRAPPC4-211ENST00000533012 AKAP13Q12802 2813 aa10.65□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF860A6NHJ4 632 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 TAF4O00268 1085 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC28A1O00337 649 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 KLF11O14901 512 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHST10O43529 356 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 RDH16O75452 317 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SEMA3DO95025 777 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ETHE1O95571 254 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 B3GALT4O96024 378 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 LIFP15018 202 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 IL10P22301 178 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 PTPN4P29074 926 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 IMPG1Q17R60 797 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 BROXQ5VW32 411 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 CES4AQ5XG92 561 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SCIMPQ6UWF3 145 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 COX15Q7KZN9 410 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBE3DQ7Z6J8 389 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 VASH2Q86V25 355 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPACA3Q8IXA5 215 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 AMER3Q8N944 861 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 AGR3Q8TD06 166 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 LRRC8CQ8TDW0 803 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 MIEF2Q96C03 454 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 QRFPRQ96P65 431 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 HBEGFQ99075 208 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCT7Q99832 543 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 C20orf27Q9GZN8 174 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC26A1Q9H2B4 701 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 WDR54Q9H977 334 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 HCN3Q9P1Z3 774 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 NCOR2Q9Y618 2525 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ADAMTS20P59510 1910 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ASPMQ8IZT6 3477 aa10.64□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ARHGAP10A1A4S6 786 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 VSTM2BA6NLU5 285 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 C4orf51C9J302 202 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 RTCAO00442 366 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 PLPP1O14494 284 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 RGS14O43566 566 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 DNAJB6O75190 326 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZGLP1P0C6A0 271 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 F8A1P23610 371 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ARRB2P32121 409 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SSR2P43308 183 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 HTR6P50406 440 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 OLR1P78380 273 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLAMF1Q13291 335 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 RUNX2Q13950 521 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 NKG7Q16617 165 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SYT16Q17RD7 645 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 UGT3A2Q3SY77 523 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 VWA2Q5GFL6 755 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPDYAQ5MJ70 313 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 CYP20A1Q6UW02 462 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM198BQ6UWH4 519 aa10.63□□□□□ -0.71
TRAPPC4-211ENST00000533012 ATG14Q6ZNE5 492 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms