RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ABCA4	P78363	2273 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SGK494	L7N484	410 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	NDUFS4	O43181	175 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	RDH16	O75452	317 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FH	P07954	510 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CDH1	P12830	882 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CD46	P15529	392 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	NPPB	P16860	134 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ALOX12	P18054	663 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	AHR	P35869	848 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	RHAG	Q02094	409 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TUBA3C	Q13748	450 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	NSDHL	Q15738	373 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	EID3	Q8N140	333 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	BEST3	Q8N1M1	668 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FBXL8	Q96CD0	374 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PGM2	Q96G03	612 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SCMH1	Q96GD3	660 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	NDN	Q99608	321 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FEZF1	A0PJY2	475 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120		A8MUI8	341 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	NDC80	O14777	642 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TSPAN12	O95859	305 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM107A	O95990	144 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	GSTM2	P28161	218 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PLTP	P55058	493 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CDKN2D	P55273	166 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CDSN	Q15517	529 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	OR1C1	Q15619	314 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PHKG1	Q16816	387 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	BBS9	Q3SYG4	887 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	NT5C	Q8TCD5	201 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SNF8	Q96H20	258 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	GPR137	Q96N19	417 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CENPH	Q9H3R5	247 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PELI2	Q9HAT8	420 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	OR1F1	O43749	312 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	AHSG	P02765	367 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	HNMT	P50135	292 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	OR4D2	P58180	307 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC26A5	P58743	744 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CDKL1	Q00532	357 aa		11.24	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms