RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 FAM72DQ6L9T8 149 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FAM72BQ86X60 149 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 OR2T11Q8NH01 316 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FAM162AQ96A26 154 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf74Q96LT6 269 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SEC22BO75396 215 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CSF3P09919 207 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 GJA4P35212 333 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CSKP41240 450 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 HTR4Q13639 388 aa9.71□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 DGKKQ5KSL6 1271 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 KIF18BQ86Y91 864 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CPXM2Q8N436 756 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 NPWQ8N729 165 aa9.71□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.71□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 TRMOQ9BU70 441 aa9.71□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 TM6SF2Q9BZW4 377 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 NT5MQ9NPB1 228 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 GPR83Q9NYM4 423 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 LAMTOR5O43504 91 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 EFEMP2O95967 443 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CYP17A1P05093 508 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 STSP08842 583 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 RAB25P57735 213 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 GPR85P60893 370 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 GPR68Q15743 365 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF77Q15935 545 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SAXO2Q658L1 398 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf111Q8N326 155 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ST8SIA4Q92187 359 aa9.71□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.71□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.71□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 MYLKQ15746 1914 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 MYO1GB0I1T2 1018 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 GNPDA1P46926 289 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CDKN2DP55273 166 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 SCN1BQ07699 218 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 CDH17Q12864 832 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 PPA2Q9H2U2 334 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.7□□□□□ -0.86
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TRPS1-211ENST00000520276 XKRXQ6PP77 449 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-211ENST00000520276 IFT22Q9H7X7 185 aa9.7□□□□□ -0.86
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