RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SERF1AO75920 110 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLTBP09497 229 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DLATP10515 647 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRK1Q38SD2 2015 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAV24A0A0B4J272 114 aa0.54□□□□□ -2.32
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATL1Q8WXF7 558 aa0.53□□□□□ -2.32
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 NMUR1Q9HB89 426 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXOC1Q9NV70 894 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSD3Q9NYI0 1048 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCPG1Q9ULG6 757 aa0.53□□□□□ -2.32
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