RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CYC1P08574 325 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SBK3P0C264 359 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 GSTM2P28161 218 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ST13P50502 369 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SKP1P63208 163 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNC4Q03721 635 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 MFAP5Q13361 173 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 NSDHLQ15738 373 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 GRHL2Q6ISB3 625 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ISLR2Q6UXK2 745 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE3DQ7Z6J8 389 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ZADH2Q8N4Q0 377 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM47BQ8NA70 645 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2L5Q8NG80 312 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP4R1Q8TF05 950 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SLAMF7Q9NQ25 335 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 NECTIN3Q9NQS3 549 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 NTNG1Q9Y2I2 539 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXO6A8MYZ6 492 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SAP18O00422 153 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDH17O14917 1159 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 RNH1P13489 461 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 EPB42P16452 691 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 JAK1P23458 1154 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTFP26441 200 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP2P42575 452 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2H2Q13888 395 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC29A2Q14542 456 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 BTBD16Q32M84 506 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 CRB2Q5IJ48 1285 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PAGE2BQ5JRK9 111 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 FCRLBQ6BAA4 426 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD17CQ6PCB6 329 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 QSOX2Q6ZRP7 698 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 LAS2Q8IYD9 372 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PLPP5Q8NEB5 264 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 CATSPER1Q8NEC5 780 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 TM9SF4Q92544 642 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF21BQ96EK2 531 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SCYL1Q96KG9 808 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK15Q96Q40 435 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 NPAS2Q99743 824 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 EPS8L2Q9H6S3 715 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G3Q9NZ20 509 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN16Q9Y5I7 305 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 OR7A17O14581 309 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 MAN1A2O60476 641 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SHBGP04278 402 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 IL10P22301 178 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP2R1BP30154 601 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3CGP48736 1102 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDH1Q08174 1060 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 LAPTM5Q13571 262 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PLAG1Q6DJT9 500 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 NIPAL1Q6NVV3 410 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 MED27Q6P2C8 311 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM40Q6P9F5 258 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRD1Q6QNK2 874 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM151AQ8N4L1 468 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 OR7G3Q8NG95 312 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52B6Q8NGF0 335 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 MZB1Q8WU39 189 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC16BQ96JE7 1060 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 FAR2Q96K12 515 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PTCHD1Q96NR3 888 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDM7Q9NQW5 492 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP10Q9P2G4 905 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PCTPQ9UKL6 214 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SVILO95425 2214 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ESPL1Q14674 2120 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GTL3 188 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC189A1A4V9 331 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GALT2O43825 422 aa17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.4 ms