RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498804.1

TRBVA-201, Transcript of T cell receptor beta variable A (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBVA, Length 316 nt, Biotype TR V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBVA-201ENST00000498804 AUP1Q9Y679 476 aa2.11□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 UMODL1Q5DID0 1318 aa2.11□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF732B4DXR9 585 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 E9PAM4 449 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 CCDC188H7C350 402 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 HAT1O14929 419 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 INPP4BO15327 924 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 PPIP5K2O43314 1243 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 TXNL1O43396 289 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ACSL4O60488 711 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF253O75346 499 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ANGPTL1O95841 491 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ANPEPP15144 967 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ADRA2CP18825 462 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 KLK2P20151 261 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 BDNFP23560 247 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 GIFP27352 417 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SRD5A2P31213 254 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 DRD3P35462 400 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 KRT20P35900 424 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 FEN1P39748 380 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 BACE1P56817 501 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ACY1Q03154 408 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SULT2A1Q06520 285 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 IL10RBQ08334 325 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 Q1RN00 199 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ATAD3CQ5T2N8 411 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 MFSD4BQ5TF39 518 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 FAM46CQ5VWP2 391 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 KRT80Q6KB66 452 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 NEPROQ6NW34 567 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 FUT10Q6P4F1 479 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 MACC1Q6ZN28 852 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 GPR141Q7Z602 305 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 PCGF5Q86SE9 256 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SERINC5Q86VE9 423 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 NME8Q8N427 588 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 LRRCC1Q9C099 1032 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 C3orf14Q9HBI5 128 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 MRGBPQ9NV56 204 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ZNF446Q9NWS9 450 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 CLEC5AQ9NY25 188 aa2.1□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 TRAV18A0A075B6X5 111 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 TCP10L2B9ZVM9 353 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 PGRMC2O15173 223 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 FLRT2O43155 660 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 LY6G6DO95868 133 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 MT-ND1P03886 318 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 THY1P04216 161 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 FAM58BPP0C7Q3 252 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SPP1P10451 314 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ATP6V1B1P15313 513 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ERCC2P18074 760 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 PTAFRP25105 342 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 PRKCIP41743 596 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 CRYBA2P53672 197 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 GCKRQ14397 625 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 GRB14Q14449 540 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM44Q2T9K0 475 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 C1orf141Q5JVX7 400 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 C17orf107Q6ZR85 190 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 Q71RC1 249 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 LRRC49Q8IUZ0 686 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SLC34A3Q8N130 599 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 PRSS35Q8N3Z0 413 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 CCDC191Q8NCU4 936 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 MRAPQ8TCY5 172 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SLC26A7Q8TE54 656 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SMPDL3AQ92484 453 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 RADILQ96JH8 1075 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 INTS14Q96SY0 518 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 PCDHB18PQ96TA0 734 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 APOL2Q9BQE5 337 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 LIME1Q9H400 295 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SP140LQ9H930 580 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 MARCH7Q9H992 704 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 WDR41Q9HAD4 459 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
TRBVA-201ENST00000498804 A0A1B0GTH9 108 aa2.08□□□□□ -2.08
TRBVA-201ENST00000498804 FAM220BPB1ANY3 271 aa2.08□□□□□ -2.08
TRBVA-201ENST00000498804 TMEM150CB9EJG8 249 aa2.08□□□□□ -2.08
TRBVA-201ENST00000498804 IGHG1P01857 330 aa2.08□□□□□ -2.08
TRBVA-201ENST00000498804 GBAP04062 536 aa2.08□□□□□ -2.08
TRBVA-201ENST00000498804 FAM200BP0CF97 657 aa2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms