RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 C2orf74A8MZ97 194 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 F8W036 122 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 SMLR1H3BR10 107 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 MID1O15344 667 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 MMP20O60882 483 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 MT-ND1P03886 318 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 FCER2P06734 321 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 NR2C1P13056 603 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 STMN1P16949 149 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 CCR10P46092 362 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 METAP1P53582 386 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 RAB14P61106 215 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 DGCR6Q14129 220 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF273Q14593 569 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 IRF3Q14653 427 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 AANATQ16613 207 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF284Q2VY69 593 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 OR8H3Q8N146 312 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 CPXM2Q8N436 756 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 GUCD1Q96NT3 240 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 FZD3Q9NPG1 666 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 IL36AQ9UHA7 158 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
ROBO1-211ENST00000498428 DHRS12A0PJE2 317 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CCDC154A6NI56 674 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 VSTM5A8MXK1 200 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 C2P06681 752 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MPSTP25325 297 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MC4RP32245 332 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 GZMKP49863 264 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CAPZA1P52907 286 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 STX5Q13190 355 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF404Q494X3 552 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM215Q68D42 235 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MACC1Q6ZN28 852 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 KIF18BQ86Y91 864 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 LGALS12Q96DT0 336 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 FCRL5Q96RD9 977 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MMP28Q9H239 520 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PDE10AQ9Y233 779 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MED16Q9Y2X0 877 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 COL6A3P12111 3177 aa6.96□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 BTN3A1O00481 513 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 SLC22A5O76082 557 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PCCBP05166 539 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CHRNGP07510 517 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 C7P10643 843 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PRG2P13727 222 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 MAP2K4P45985 399 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 RFX2P48378 723 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 LGALS3BPQ08380 585 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TNK1Q13470 666 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 POU4F3Q15319 338 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 AARDQ4LEZ3 155 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PPM1JQ5JR12 505 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 RAB12Q6IQ22 244 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 Q6ZVL8 140 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 COMMD7Q86VX2 200 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PTERQ96BW5 349 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 YIPF6Q96EC8 236 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 NODALQ96S42 347 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.95□□□□□ -1.3
ROBO1-211ENST00000498428 IL22Q9GZX6 179 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.4 ms