RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q0VFX4	171 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM205	Q6UW68	189 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	LAS2	Q8IYD9	372 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	GALNT16	Q8N428	558 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	F2RL3	Q96RI0	385 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	IPPK	Q9H8X2	491 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	LANCL2	Q9NS86	450 aa		14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325		A8MT66	165 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR7A17	O14581	309 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMIM24	O75264	130 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SH3BGRL	O75368	114 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLDN1	O95832	211 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCNA	P12004	261 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	COX6A1	P12074	109 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACPP	P15309	386 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	GSTM2	P28161	218 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	BTN3A2	P78410	334 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	RUNX2	Q13950	521 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	MED27	Q6P2C8	311 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TDRP	Q86YL5	185 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR7G3	Q8NG95	312 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	QRFPR	Q96P65	431 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	MS4A8	Q9BY19	250 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCTP	Q9UKL6	214 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMCO1	Q9UM00	188 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		14.93	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM227A	F5H4B4	570 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TGFB1	P01137	390 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PIK3CG	P48736	1102 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PGD	P52209	483 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLA2G16	P53816	162 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SOX8	P57073	446 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCOLCE	Q15113	449 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	LIPJ	Q5W064	366 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CA13	Q8N1Q1	262 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TEX19	Q8NA77	164 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR2L5	Q8NG80	312 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDK15	Q96Q40	435 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACTR8	Q9H981	624 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPR83	Q9NYM4	423 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	EMCN	Q9ULC0	261 aa		14.92	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A1B0GTL3	188 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A1W2PQ72	361 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TLDC2	A0PJX2	215 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPP6C	O00743	305 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	DLX3	O60479	287 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	B4GALT2	O60909	372 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	VPS4B	O75351	444 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	HP	P00738	406 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	FH	P07954	510 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	CELA2A	P08217	269 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT15	P19012	456 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSPAN8	P19075	237 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITGA3	P26006	1051 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	SKP1	P63208	163 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	BTG2	P78543	158 aa		14.91	□□□□□ -0.02
PRKCZ-222	ENST00000496325	RHAG	Q02094	409 aa		14.91	□□□□□ -0.02

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