RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 HOGA1Q86XE5 327 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 OR6S1Q8NH40 331 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 DTD2Q96FN9 168 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 FSD1Q9BTV5 496 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ETV7Q9Y603 341 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 TLR4O00206 839 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEB2O15479 319 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-FP30511 346 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SOX3P41225 446 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PAX9P55771 341 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK10P57789 538 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK2BP67870 215 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 IRX4P78413 519 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CNTN1Q12860 1018 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 STHQ8IWL8 128 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 AZIN2Q96A70 460 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PROCRQ9UNN8 238 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 WDR81Q562E7 1941 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 HHLA1C9JL84 531 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MLNRO43193 412 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PRPSAP2O60256 369 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GMNNO75496 209 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 UMODP07911 640 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SFTPBP07988 381 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT17P0C025 328 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SKILP12757 684 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GNB3P16520 340 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ACKR3P25106 362 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 TNFSF10P50591 281 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 XGP55808 180 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PDK1Q15118 436 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SPHARQ15513 63 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF876PQ49A33 203 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 NEK5Q6P3R8 708 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CCNYQ8ND76 341 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 TRPV3Q8NET8 790 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35C1Q96A29 364 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PIGVQ9NUD9 493 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF580Q9UK33 172 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SERINC4A6NH21 518 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC69A6NI79 296 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL14O95715 111 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 EPOP01588 193 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SLC4A1P02730 911 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNGP07510 517 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PATE4P0C8F1 98 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ODC1P11926 461 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-11P60412 298 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GAMTQ14353 236 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 OR4A16Q8NH70 328 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM186Q96B77 213 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO17Q96EF6 278 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PRAC1Q96KF2 57 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf48Q96LS8 159 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA13Q96N96 652 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 NTMT1Q9BV86 223 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 CARD9Q9H257 536 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.68□□□□□ -1.34
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