RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM245Q9H330 911 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH7Q9ULB5 785 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNK6Q9Y257 313 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FEZF1A0PJY2 475 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf105O95561 183 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKACBP22694 351 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGB7P26010 798 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPN6P29350 595 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DRD3P35462 400 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGKEP52429 567 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGDIAP52565 204 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VBP1P61758 197 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR7G3Q8NG95 312 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DOK1Q99704 481 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC31A1O15431 190 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HPRP00739 348 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RETP07949 1114 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPS2P11908 318 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSTM2P28161 218 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS2R38P59533 333 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVK-21P61565 698 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABHD18Q0P651 414 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDDC3Q8N4P3 179 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2T29Q8NH02 315 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR48Q8TAF3 677 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.88□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LILRB5O75023 590 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFS2O75306 463 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACP5P13686 325 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPRL1P41146 370 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GZMMP51124 257 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPN5P54829 565 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPTX1Q15818 432 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF691Q5VV52 312 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR153Q6NV75 609 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPM1DO15297 605 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPIND1P05546 499 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPC1LP0DKB6 136 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JUPP14923 745 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACPPP15309 386 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMBIM6P55061 237 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDGFRLQ15198 375 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FLCNQ8NFG4 579 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDNFQ8TB73 568 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOPNLQ96NB1 174 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.87□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN11A1L157 253 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FABP3P05413 133 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RB1P06400 928 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IDUAP35475 653 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR1E2P47887 323 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCDC1P59894 354 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGL2Q14314 439 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFA5Q16718 116 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VMACQ2NL98 169 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AHSA2Q719I0 299 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RORBQ92753 470 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.86□□□□□ -0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms