RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCUBE1Q8IWY4 988 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CA13Q8N1Q1 262 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM52Q8NDY8 209 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 B3GNT7Q8NFL0 401 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZFP69BQ9UJL9 534 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 LIPGQ9Y5X9 500 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 COMMD10Q9Y6G5 202 aa13.27□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 SDR42E2A6NKP2 422 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 COL6A5A8TX70 2615 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 NPIPA2E9PIF3 369 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 NPIPA3F8WFD2 350 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC16A5O15375 505 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGHG3P01860 377 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 FGGP02679 453 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 C8GP07360 202 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 GLI4P10075 376 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 MLNP12872 115 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 PAMP19021 973 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADH7P40394 386 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CDKN2DP55273 166 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CES4AQ5XG92 561 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 TTC27Q6P3X3 843 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CASC4Q6P4E1 433 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 GSTA5Q7RTV2 222 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM200AQ86VY9 491 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 MCUQ8NE86 351 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 NEIL2Q969S2 332 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 SERPINB12Q96P63 405 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 NDNQ99608 321 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 TTYH2Q9BSA4 534 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 KCMF1Q9P0J7 381 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa13.26□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A0G2JNJ9 132 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1B0GVC2 190 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 USP27XA6NNY8 438 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 FCHO1O14526 889 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 MYO1DO94832 1006 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 RNH1P13489 461 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 PTMSP20962 102 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCND1P24385 295 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 GRK3P35626 688 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 AHRP35869 848 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 HNF4AP41235 474 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 VPS41P49754 854 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CLCN2P51788 898 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 PPIAP62937 165 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 SP140Q13342 867 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 RUNX2Q13950 521 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 TERF2Q15554 542 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 DUPD1Q68J44 220 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 ACAD11Q709F0 780 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM156Q8N614 296 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 PSD4Q8NDX1 1056 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR2M7Q8NG81 312 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR5M9Q8NGP3 310 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 NINJ1Q92982 152 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 NCLNQ969V3 563 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 PDLIM2Q96JY6 352 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 HAUS8Q9BT25 410 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCDC68Q9H2F9 335 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 RHBGQ9H310 441 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 Q9UFV3 132 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 GUCA1BQ9UMX6 200 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CSPG4Q6UVK1 2322 aa13.25□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATRQ13535 2644 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM166BA8MTA8 275 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 PROM1O43490 865 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR6B1O95007 311 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 SERPIND1P05546 499 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 CELA3AP09093 270 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 ACVR2AP27037 513 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 REEP5Q00765 189 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 FOXO1Q12778 655 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 GPS1Q13098 491 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 MYBPHQ13203 477 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 LMNTD2Q8IXW0 634 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC5A11Q8WWX8 675 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 FBXL8Q96CD0 374 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 TTTY12Q9BZ98 90 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 RBSNQ9H1K0 784 aa13.24□□□□□ -0.29
SDCCAG3-211ENST00000486441 PLAC1Q9HBJ0 212 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms