RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 OR7G3Q8NG95 312 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 REPS1Q96D71 796 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PTCHD1Q96NR3 888 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 F2RL3Q96RI0 385 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ROGDIQ9GZN7 287 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PPCSQ9HAB8 311 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LANCL2Q9NS86 450 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TTLL8A6PVC2 850 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 GOLGA8RI6L899 631 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 E2F3O00716 465 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PRMT3O60678 531 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TGFB1P01137 390 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SERPINA7P05543 415 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CCNG1P51959 295 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MTTPP55157 894 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RHAGQ02094 409 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TLE1Q04724 770 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ABRAXAS2Q15018 415 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ADNP2Q6IQ32 1131 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ABHD17CQ6PCB6 329 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ARMC2Q8NEN0 867 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CMTM7Q96FZ5 175 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SERINC2Q96SA4 455 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CENPKQ9BS16 269 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM4Q9C037 500 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 EPN3Q9H201 632 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SLAMF7Q9NQ25 335 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 C4orf51C9J302 202 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CLDN9O95484 217 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SHBGP04278 402 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PRR35P0CG20 571 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PYGBP11216 843 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT15P19012 456 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 EFNA3P52797 238 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 OR4D2P58180 307 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RUNX2Q13950 521 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RCN2Q14257 317 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM35AQ53FP2 167 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 IGFL3Q6UXB1 125 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ISLR2Q6UXK2 745 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 QRFPRQ96P65 431 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNC2Q96PR1 638 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LMF1Q96S06 567 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LPAR4Q99677 370 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TBCDQ9BTW9 1192 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MS4A8Q9BY19 250 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 DCDC2Q9UHG0 476 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 KALRNO60229 2985 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM23A6NLE4 172 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM227AF5H4B4 570 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 CLDN4O14493 209 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3BGRLO75368 114 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 GSTA1P08263 222 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 PIK3CBP42338 1070 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 SLCO1A2P46721 670 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 RAP1GDS1P52306 607 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB38P57729 211 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 VSNL1P62760 191 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 BTG2P78543 158 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 AP5B1Q2VPB7 878 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 BTBD16Q32M84 506 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 SFT2D3Q587I9 215 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 CRB2Q5IJ48 1285 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 QSOX2Q6ZRP7 698 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP4X1Q8N118 509 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 L3MBTL4Q8NA19 623 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP4R1Q8TF05 950 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 TSLPQ969D9 159 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 PNPLA2Q96AD5 504 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 IMMP1LQ96LU5 166 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 PRDM9Q9NQV7 894 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 PTGFRNQ9P2B2 879 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 H0YIV9 168 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 EXT1Q16394 746 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 DEPDC1Q5TB30 811 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC6A19Q695T7 634 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-209ENST00000484097 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms