RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	OR2L5	Q8NG80	312 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	MIB2	Q96AX9	1013 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	PHF21B	Q96EK2	531 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		27.56	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	SH3BGRL	O75368	114 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	BTG2	P78543	158 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	GTF2H2	Q13888	395 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2	5e-6	■■■□□ 18.6
FBXO18-208	ENST00000470089	BTBD16	Q32M84	506 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	LGSN	Q5TDP6	509 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	QRFPR	Q96P65	431 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CLMP	Q9H6B4	373 aa		27.55	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	COL6A2	P12110	1019 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDH1	Q08174	1060 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	MFAP5	Q13361	173 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	LAS2	Q8IYD9	372 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	RNF175	Q8N4F7	328 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	OR7G3	Q8NG95	312 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	UBE2E3	Q969T4	207 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	MS4A8	Q9BY19	250 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	ACTR8	Q9H981	624 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	MAP10	Q9P2G4	905 aa		27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	B3GALT2	O43825	422 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	PRMT3	O60678	531 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	ICAM2	P13598	275 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	MAOA	P21397	527 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CERS1	P27544	350 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	OR4D2	P58180	307 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089		Q6ZS92	163 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CUZD1	Q86UP6	607 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CNDP1	Q96KN2	507 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	IPPK	Q9H8X2	491 aa		27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A088AWK7	358 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	E2F3	O00716	465 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	SMIM24	O75264	130 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	TGFB1	P01137	390 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	SOX11	P35716	441 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP4X1	Q8N118	509 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	MTBP	Q96DY7	904 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	LMF1	Q96S06	567 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		27.52	■■■□□ 2
FBXO18-208	ENST00000470089	TGM3	Q08188	693 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	SERINC2	Q96SA4	455 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	LPAR4	Q99677	370 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	TBK1	Q9UHD2	729 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	TMCO1	Q9UM00	188 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	F10	P00742	488 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	MTTP	P55157	894 aa		27.5	■■□□□ 1.99
FBXO18-208	ENST00000470089	RAB38	P57729	211 aa		27.5	■■□□□ 1.99

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