RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 SFT2D3Q587I9 215 aa22.56■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.56■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.56■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 CA13Q8N1Q1 262 aa22.56■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 AMER2Q8N7J2 671 aa22.56■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 OR2L5Q8NG80 312 aa22.56■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 SCYL1Q96KG9 808 aa22.56■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 CNDP1Q96KN2 507 aa22.56■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF358Q9NW07 568 aa22.56■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 RIPK2O43353 540 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 KLK8O60259 260 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PRMT3O60678 531 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 RBP1P09455 135 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 SOX11P35716 441 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 OR4D2P58180 307 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 E2F2Q14209 437 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 BTBD16Q32M84 506 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 LGSNQ5TDP6 509 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 MED27Q6P2C8 311 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 CUZD1Q86UP6 607 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 FAM227AF5H4B4 570 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 B3GALT2O43825 422 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 VPS4BO75351 444 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PCNAP12004 261 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 COL6A2P12110 1019 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 BTG2P78543 158 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PCDH1Q08174 1060 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TGM3Q08188 693 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PLAG1Q6DJT9 500 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 F2RL3Q96RI0 385 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 LPAR4Q99677 370 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 VPS4AQ9UN37 437 aa22.54■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 ARG2P78540 354 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 RUNX2Q13950 521 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 EXT1Q16394 746 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 ABHD17CQ6PCB6 329 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 QSOX2Q6ZRP7 698 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 LAS2Q8IYD9 372 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 CYP4X1Q8N118 509 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 QRFPRQ96P65 431 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 DYTNA2CJ06 578 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 MAOAP21397 527 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINB1P30740 379 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 MTTPP55157 894 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 GTF2H2Q13888 395 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TLR1Q15399 786 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TEX35Q5T0J7 233 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 GALNT11Q8NCW6 608 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 OR7G3Q8NG95 312 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 C19orf60Q96EN9 201 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 SERINC2Q96SA4 455 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 MS4A8Q9BY19 250 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 ACTR8Q9H981 624 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 PLA2G3Q9NZ20 509 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 XPR1Q9UBH6 696 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 TMCO1Q9UM00 188 aa22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SMKR1-201ENST00000462322 SHANK1Q9Y566 2161 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 A8MUI8 341 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 SMIM24O75264 130 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 CERS1P27544 350 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 GCAP28676 217 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 PIK3CGP48736 1102 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 RAB38P57729 211 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 SLC29A2Q14542 456 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ABHD17BQ5VST6 288 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.51■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms