RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 TBK1Q9UHD2 729 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF225Q9UK10 706 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 EMCNQ9ULC0 261 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PLAAQ9Y263 795 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NCKAP5O14513 1909 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 J3QKU1 62 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC3AO75596 197 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 WISP2O76076 250 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 F10P00742 488 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHEP01854 428 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR35P0CG20 571 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GFAPP14136 432 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ACPPP15309 386 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MAOAP21397 527 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGA3P26006 1051 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF8P28908 595 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP2R1BP30154 601 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CASRP41180 1078 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SLCO1A2P46721 670 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NEK2P51955 445 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PGDP52209 483 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G16P53816 162 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RRADP55042 308 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IRF8Q02556 426 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS1Q08116 209 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 KLRB1Q12918 225 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2H2Q13888 395 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HERC3Q15034 1050 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TBCCQ15814 346 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC50Q53HI1 259 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A19Q695T7 634 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CUZD1Q86UP6 607 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LAS2Q8IYD9 372 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OR7G3Q8NG95 312 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NACC2Q96BF6 587 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf60Q96EN9 201 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SCYL1Q96KG9 808 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IP6K3Q96PC2 410 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LHPPQ9H008 270 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 EHD1Q9H4M9 534 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OPTCQ9UBM4 332 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PCTPQ9UKL6 214 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 SYCE1LA8MT33 242 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MT66 165 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MUA0 341 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 CYR61O00622 381 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PLPP1O14494 284 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 DLX3O60479 287 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT38O76015 456 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 FHP07954 510 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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