RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 CA13Q8N1Q1 262 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 OR2L5Q8NG80 312 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 M1APQ8TC57 530 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 HAS2Q92819 552 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 ISL2Q96A47 359 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 GPR78Q96P69 363 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 CSAG2Q9Y5P2 127 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 C4orf51C9J302 202 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 KLK8O60259 260 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 CD22P20273 847 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 MED27Q6P2C8 311 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 C19orf60Q96EN9 201 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 PRDM9Q9NQV7 894 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 STMN3Q9NZ72 180 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 COL6A2P12110 1019 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 PLA2G16P53816 162 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 TEX9Q8N6V9 391 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 DCAKDQ8WVC6 231 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 ROGDIQ9GZN7 287 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 MMP25Q9NPA2 562 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 ASF1BQ9NVP2 202 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 A8MUI8 341 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 LAS2Q8IYD9 372 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 ZNF354BQ96LW1 612 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 RNF32Q9H0A6 362 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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PTPN4-208ENST00000460289 F2RL3Q96RI0 385 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 TRAV17A0A0B4J275 112 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPN4-208ENST00000460289 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa21.58■■□□□ 1.05
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