RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 HPF1Q9NWY4 346 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.61□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 MAGEB16A2A368 324 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 NPPBP16860 134 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 SAT1P21673 171 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 IST1P53990 364 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 REEP5Q00765 189 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 CSHL1Q14406 222 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 ARMC3Q5W041 872 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 DUPD1Q68J44 220 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 CA13Q8N1Q1 262 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 NT5CQ8TCD5 201 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 VMP1Q96GC9 406 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 SERPINB12Q96P63 405 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 SMC6Q96SB8 1091 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 EXO5Q9H790 373 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 PNPLA3Q9NST1 481 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 ZFATQ9P243 1243 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.6□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 NCKAP5O14513 1909 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0G2JMM0 328 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0G2JN53 185 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PPB8 328 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PRS3 328 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 PINLYPA6NC86 204 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 MLNP12872 115 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 PPP2R1BP30154 601 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 CXCR5P32302 372 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 SCTRP47872 440 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 CDKN2DP55273 166 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 BTN3A2P78410 334 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 FOLH1Q04609 750 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 SLC13A2Q13183 592 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 CEBPEQ15744 281 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 IL20RBQ6UXL0 311 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 GPATCH11Q8N954 259 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 FAM47BQ8NA70 645 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 OR56A3Q8NH54 315 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 ATL1Q8WXF7 558 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 NEIL2Q969S2 332 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 FAR2Q96K12 515 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 OR4K3Q96R72 315 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 KLHL31Q9H511 634 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 DEPPQ9NTK1 212 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.59□□□□□ -0.87
DDX39B-211ENST00000449757 LIPGQ9Y5X9 500 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms