RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CLLU1Q5K131 121 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKS6Q68DC2 871 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TRILQ7L0X0 811 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC34A3Q8N130 599 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8NFD4 153 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FANK1Q8TC84 345 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9A6Q92581 669 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9A7Q96T83 725 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 WACQ9BTA9 647 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RERGLQ9H628 205 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IL20Q9NYY1 176 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ING4Q9UNL4 249 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NME7Q9Y5B8 376 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SYN3O14994 580 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PER2O15055 1255 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4F21O95013 312 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TPOP07202 933 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ADRA2AP08913 450 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR7P34969 479 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SOX3P41225 446 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCN4P51793 760 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SMSP52788 366 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRCAPQ14761 206 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGR1Q14914 329 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FCN2Q15485 313 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AARDQ4LEZ3 155 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIQKQ629K1 86 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC66Q68CR7 880 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PTP4A1Q93096 173 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 WDFY2Q96P53 400 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OPALINQ96PE5 141 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf57Q99622 126 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CCM2Q9BSQ5 444 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RHBGQ9H310 441 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM245Q9H330 911 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGVQ9NUD9 493 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF222Q9UK12 451 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRDP23468 1912 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SCN1AP35498 2009 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ORC5O43913 435 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCL10P02778 98 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSM4P0C7M7 580 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 POU2F1P14859 743 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR6P50406 440 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf80Q0P641 193 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NR6A1Q15406 480 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZSR9 355 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF605Q86T29 641 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC16Q8NEE8 873 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR152Q8TDT2 470 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB12Q8WXK4 309 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 UFD1Q92890 307 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 COL26A1Q96A83 441 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MENTQ9BUN1 341 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms