RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM40Q6P9F5 258 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 SATL1Q86VE3 508 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 RGMAQ96B86 450 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 APBB3O95704 486 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 C6orf47O95873 294 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 FABP3P05413 133 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PAX7P23759 505 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ALDH3B2P48448 385 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 MVDP53602 400 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 NFATC4Q14934 902 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 CLCA4Q14CN2 919 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 HEPACAMQ14CZ8 416 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 MPEG1Q2M385 716 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2A1Q8NGT9 310 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC35A5Q9BS91 424 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM184CQ9NVA4 438 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ADPRHL2Q9NX46 363 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 C3orf18Q9UK00 162 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 GPSM3Q9Y4H4 160 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PRB8 838 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PRSS38A1L453 326 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PRR23AA6NEV1 266 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 NDUFS4O43181 175 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 NOBOXO60393 691 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 TNFRSF21O75509 655 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF682O95780 498 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ACADMP11310 421 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 MAPK12P53778 367 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT33BQ14525 404 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 RPE65Q16518 533 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 NADK2Q4G0N4 442 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 GCNT6Q5T4J0 391 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2T5Q6IEZ7 315 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC80Q76M96 950 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 TBC1D19Q8N5T2 526 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 METTL25Q8N6Q8 603 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2T29Q8NH02 315 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 FBXL20Q96IG2 436 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC6A17Q9H1V8 727 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 H7BY64 318 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 TOR1BO14657 336 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 TNFRSF10CO14798 259 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP2CBP62714 309 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP2CAP67775 309 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 MC1RQ01726 317 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 CNPY1Q3B7I2 92 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 OR52E1Q8NGJ3 308 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 OR5P2Q8WZ92 322 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 MRGPRX1Q96LB2 322 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAP1Q96NZ9 151 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 UTS2RQ9UKP6 389 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 BAG5Q9UL15 447 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 DMTF1Q9Y222 760 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 E2F6O75461 281 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP6V1B1P15313 513 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 UQCRC2P22695 453 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 PSMB5P28074 263 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 GRK3P35626 688 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 FRKP42685 505 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 RPS6KA3P51812 740 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGDIAP52565 204 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 IL18R1Q13478 541 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 IER5LQ5T953 404 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF786Q8N393 782 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 TM4SF18Q96CE8 201 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 FGF22Q9HCT0 170 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 NEUROD4Q9HD90 331 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 TAAR2Q9P1P5 351 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 AHCYL1O43865 530 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 GBAP04062 536 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 FESP07332 822 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 AHRP35869 848 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 RAD23AP54725 363 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ITGA1P56199 1179 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ZIC1Q15915 447 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 21
SH3BP2-202ENST00000435136 SPESP1Q6UW49 350 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 NAGSQ8N159 534 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF555Q8NEP9 628 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 CREB3L4Q8TEY5 395 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 HSH2DQ96JZ2 352 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR92Q96MX6 357 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 F2RL3Q96RI0 385 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 GRIP2Q9C0E4 1043 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC6A16Q9GZN6 736 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms