RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 OR5M9Q8NGP3 310 aa3.52□□□□□ -1.85
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RBM39-211ENST00000426951 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.52□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 RASL10BQ96S79 203 aa3.52□□□□□ -1.85
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RBM39-211ENST00000426951 ZNF263O14978 683 aa3.49□□□□□ -1.85
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RBM39-211ENST00000426951 CLN5O75503 358 aa3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RBM39-211ENST00000426951 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
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