RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABARAPL2P60520 117 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REEP5Q00765 189 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBBP4Q09028 425 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAPSNQ13702 412 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC01555Q8NAE3 123 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAP1Q96NZ9 151 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM38AQ9H6F2 299 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1GALT1Q9NS00 363 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BLOC1S6Q9UL45 172 aa17.88■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FEZF1A0PJY2 475 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD33BA6NCL7 494 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRR23AA6NEV1 266 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 K7EQS6 105 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFXAPO00287 272 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT2B11O75310 529 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDK4P11802 303 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALK1P51570 392 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SELENOWP63302 87 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HYAL1Q12794 435 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCARB2Q14108 478 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR107Q5VW38 600 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XAF1Q6GPH4 301 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1211LQ6NV74 962 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM40Q6P9F5 258 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF130Q86XS8 419 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBLIM1Q8WUP2 373 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C12orf66Q96MD2 445 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F2RL3Q96RI0 385 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOK1Q99704 481 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIBC2Q9H4K1 309 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FANCEQ9HB96 536 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXD2Q9NVH0 621 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ICKQ9UPZ9 632 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATG2BQ96BY7 2078 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LATO43561 262 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JRKO75564 520 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BSGP35613 385 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPK12P53778 367 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS21P63220 83 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL1RL1Q01638 556 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFKBIDQ8NI38 313 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FERD3LQ96RJ6 166 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXL12Q9NXK8 326 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa17.87■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC1A7O00341 560 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9P02748 559 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OPN1SWP03999 348 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTR1AP08908 422 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP4B1P13584 511 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDCP20711 480 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINB1P30740 379 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOAT1P35610 550 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRIM2P49643 509 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGCGQ13326 291 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATAT1Q5SQI0 421 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPARTQ8N0X7 666 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SETD9Q8NE22 299 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR13F1Q8NGS4 319 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPYCQ99645 322 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMM29Q9BSF4 260 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ETAA1Q9NY74 926 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF17Q9P2E2 1029 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H3BMQ9 156 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSTM2P28161 218 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFRSF4P43489 277 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLK3P49761 638 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS6KA3P51812 740 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL5RAQ01344 420 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KEAP1Q14145 624 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM180BQ6P0A1 224 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAHD1Q6P587 224 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAGE2Q7Z2X7 111 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB42Q8N4Z0 105 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPPL2AQ8TCT8 520 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GANCQ8TET4 914 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAMM41Q96BW9 452 aa17.86■□□□□ 0.45
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms