RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 KLC1Q07866 573 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 HYAL2Q12891 473 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 BNIP2Q12982 314 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SLC14A1Q13336 389 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 FAM53BQ14153 422 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 MLC1Q15049 377 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TCEA2Q15560 299 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 AAGABQ6PD74 315 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 LAYNQ6UX15 382 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DHDDSQ86SQ9 333 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RETREG3Q86VR2 466 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PROSER1Q86XN7 944 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RNF175Q8N4F7 328 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 FAM13CQ8NE31 585 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO27Q8NI29 283 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 WDR48Q8TAF3 677 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 NCSTNQ92542 709 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 VPS33AQ96AX1 596 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PPCDCQ96CD2 204 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 EGLN2Q96KS0 407 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC115Q96NT0 180 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CGREF1Q99674 301 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ECSITQ9BQ95 431 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 NANOGQ9H9S0 305 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 LYRM4Q9HD34 91 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 CD300AQ9UGN4 299 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PHF11Q9UIL8 331 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RNF215Q9Y6U7 377 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 TRIOO75962 3097 aa9.15□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0A6YYD5 115 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0J9YVX5 310 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 H0YGG7 62 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 B4GAT1O43505 415 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 B3GALT2O43825 422 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 CTSVO60911 334 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SCN2BO60939 215 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SDC3O75056 442 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ALOX12P18054 663 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SLC6A2P23975 617 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ALDH4A1P30038 563 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 DGKQP52824 942 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 CYP4F2P78329 520 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 HSD11B2P80365 405 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SLAMF1Q13291 335 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 UGT8Q16880 541 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 IRGCQ6NXR0 463 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 VN1R4Q7Z5H5 301 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SLC15A3Q8IY34 581 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35F3Q8IY50 421 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 FAM47BQ8NA70 645 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 STMN2Q93045 179 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ASB9Q96DX5 294 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms