RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYNNQ9NPC7 610 aa16.09■□□□□ 0.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARMCX1Q9P291 453 aa16.09■□□□□ 0.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 RARRES3Q9UL19 164 aa16.09■□□□□ 0.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.08■□□□□ 0.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0G2JN53 185 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFCAB7A8K855 629 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC30A4O14863 429 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD28O15084 1053 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 B3GALT2O43825 422 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC22A3O75751 556 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT-CO3P00414 261 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 GBAP04062 536 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRPS1L1P21108 318 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TACR1P25103 407 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 C21orf58P58505 322 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXM1Q08050 763 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTGR1Q14914 329 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ISXQ2M1V0 245 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF793Q6ZN11 406 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MVB12AQ96EY5 273 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf90Q96M02 699 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSSK3Q96PN8 268 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB18Q99592 522 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDC1Q9BTX1 674 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPY30Q9C005 99 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRYLO94915 3013 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC6Q6W4X9 2439 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPN14A8MX76 684 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM58BPP0C7Q3 252 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 FTH1P19P0C7X4 201 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 GCGRP47871 477 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPRE2Q15555 327 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAOXQ6QHF9 649 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHRS13Q6UX07 377 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 BMPERQ8N8U9 685 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACTL8Q9H568 366 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO8Q9NRD0 319 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CUTCQ9NTM9 273 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYTNA2CJ06 578 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 B4E171 279 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMPRSS11DO60235 418 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL18O94889 574 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSA2O95478 260 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGF5P12034 268 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL1RNP18510 177 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CERS1P27544 350 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIK3R1P27986 724 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDX6P30041 224 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPAN7P41732 249 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 AVPR1BP47901 424 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NME5P56597 212 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAS2R50P59544 299 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 UFM1P61960 85 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MC2RQ01718 297 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLAMF1Q13291 335 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT72Q14CN4 511 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 HEPACAMQ14CZ8 416 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPY19L1Q2PZI1 675 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGKQ53H12 422 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPEARQ8WU66 669 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TESCQ96BS2 214 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TM4SF18Q96CE8 201 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTERF3Q96E29 417 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 EGLN2Q96KS0 407 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TUBB6Q9BUF5 446 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYRM4Q9HD34 91 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms