RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 CEBPBP17676 345 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 SPIBQ01892 262 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 MICAQ29983 383 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 LCTLQ6UWM7 567 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT78Q8N1N4 520 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC5A8Q8N695 610 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 NDNFQ8TB73 568 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 DNASE1L2Q92874 299 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 FBXO8Q9NRD0 319 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ANGPT4Q9Y264 503 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A1W2PRB8 838 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 K7ESM1 405 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 SAP18O00422 153 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 KLHL18O94889 574 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 NADKO95544 446 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 OPN1SWP03999 348 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 GBAP04062 536 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 KLK1P06870 262 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 C6P13671 934 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 BMPR1AP36894 532 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNC4Q03721 635 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 DGCR6Q14129 220 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 MPEG1Q2M385 716 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ADCK1Q86TW2 530 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 COPS4Q9BT78 406 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 AHSPQ9NZD4 102 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ARAFP10398 606 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 CTNNB1P35222 781 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 IDUAP35475 653 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 NIPAL1Q6NVV3 410 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 RHOXF1Q8NHV9 184 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 POF1BQ8WVV4 589 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ING5Q8WYH8 240 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PSD2Q9BQI7 771 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ITPAQ9BY32 194 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 VBP1P61758 197 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 C12orf40Q86WS4 652 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 RNF130Q86XS8 419 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 LGI4Q8N135 537 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC38A4Q969I6 547 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 SPNS1Q9H2V7 528 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ICKQ9UPZ9 632 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 UQCRC2P22695 453 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 KELP23276 732 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 TGFBR2P37173 567 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 METAP1P53582 386 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 CDH12P55289 794 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP1A4Q13733 1029 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 CYP2A13Q16696 494 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PIP5K1AQ99755 562 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF556Q9HAH1 456 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 FKBP14Q9NWM8 211 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 VIPP01282 170 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ADRB3P13945 408 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 EPCAMP16422 314 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 CD36P16671 472 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 NATD1Q8N6N6 113 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 LGALS12Q96DT0 336 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 MMP20O60882 483 aa22.08■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 IL3P08700 152 aa22.08■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 TNFRSF1BP20333 461 aa22.08■■□□□ 1.12
RABGGTA-202ENST00000399409 XCR1P46094 333 aa22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms