RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 GXYLT1Q4G148 440 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 FIGNQ5HY92 759 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 TMEM156Q8N614 296 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
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CASP4-201ENST00000393150 HAUS1Q96CS2 278 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 OLFM3Q96PB7 478 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 GBP4Q96PP9 640 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PANX2Q96RD6 677 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 LDAHQ9H6V9 325 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 EXO5Q9H790 373 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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CASP4-201ENST00000393150 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HSPB2A8KAH6 182 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SYT5O00445 386 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 FFAR3O14843 346 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CASKO14936 926 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 GPR42O15529 346 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ZNHIT1O43257 154 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CTSVO60911 334 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 WDR1O75083 606 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NEURL1O76050 574 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 WISP2O76076 250 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SKILP12757 684 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 GABRA1P14867 456 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 TPH1P17752 444 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 GDNFP39905 211 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 BCL6P41182 706 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HLCSP50747 726 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 OR4D2P58180 307 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ZNF460Q14592 562 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 MESDQ14696 234 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HSPB2Q16082 182 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 WLSQ5T9L3 541 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NPNTQ6UXI9 565 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 RNF44Q7L0R7 432 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ADCK2Q7Z695 626 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ZNF567Q8N184 647 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 Q8N1Y9 231 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 MARVELD2Q8N4S9 558 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 OR2L3Q8NG85 312 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 STYXQ8WUJ0 223 aa7.36□□□□□ -1.23
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CASP4-201ENST00000393150 SPATA13Q96N96 652 aa7.36□□□□□ -1.23
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CASP4-201ENST00000393150 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.36□□□□□ -1.23
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CASP4-201ENST00000393150 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.36□□□□□ -1.23
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CASP4-201ENST00000393150 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.35□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 H7C0C1 242 aa7.35□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 H7C0S8 307 aa7.35□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 H7C1Q1 480 aa7.35□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NRDCO43847 1150 aa7.35□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NPHS1O60500 1241 aa7.35□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 TUBB4AP04350 444 aa7.35□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 TNNT1P13805 278 aa7.35□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CTNNA2P26232 953 aa7.35□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HSD17B2P37059 387 aa7.35□□□□□ -1.23
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