RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384530.1

RNU6-35P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 35, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-35P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-35P-201ENST00000384530 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 PNMTP11086 282 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 PCP11498 1178 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 FGF5P12034 268 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 HRES1P13985 223 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 FOLR2P14207 255 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 PRLRP16471 622 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 CTSSP25774 331 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 HLA-DMBP28068 263 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 NTSP30990 170 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 CD79BP40259 229 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 RFC5P40937 340 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 GPC3P51654 580 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 RNF4P78317 190 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 KLC1Q07866 573 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 FOXI1Q12951 378 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 GTF2H3Q13889 308 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 E2F2Q14209 437 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ARHGAP19Q14CB8 494 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF79Q15937 498 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TMEM183BQ1AE95 376 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 MTERF2Q49AM1 385 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TTC32Q5I0X7 151 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF311Q5JNZ3 666 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TMEM69Q5SWH9 247 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TPRG1LQ5T0D9 272 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 IL23RQ5VWK5 629 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TXNDC8Q6A555 127 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 SPINK14Q6IE38 97 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 LETMD1Q6P1Q0 360 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ACSM6Q6P461 480 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ASCL4Q6XD76 172 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 CHST9Q7L1S5 443 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 CYB5R4Q7L1T6 521 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 STK32CQ86UX6 486 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 FAM228AQ86W67 206 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 PPP1R3BQ86XI6 285 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF354CQ86Y25 554 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 KMT5CQ86Y97 462 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 UNC45BQ8IWX7 931 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TMEM183AQ8IXX5 376 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 PRR22Q8IZ63 422 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 MUC15Q8N387 334 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 OR14C36Q8NHC7 312 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 FGFBP3Q8TAT2 258 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 GPT2Q8TD30 523 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 LRTOMTQ8WZ04 291 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 KLK6Q92876 244 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 SLC5A5Q92911 643 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 WDR92Q96MX6 357 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 SMC6Q96SB8 1091 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 S1PR3Q99500 378 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 MESP1Q9BRJ9 268 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ATG101Q9BSB4 218 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 COLEC11Q9BWP8 271 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 DEFB126Q9BYW3 111 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 MAGEB5Q9BZ81 275 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TTTY10Q9BZA0 68 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 BHMT2Q9H2M3 363 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 KANSL2Q9H9L4 492 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ADGRL4Q9HBW9 690 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 SMYD2Q9NRG4 433 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 SNTG1Q9NSN8 517 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 RNF146Q9NTX7 359 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 GINM1Q9NU53 330 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 EXD2Q9NVH0 621 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ATAD3AQ9NVI7 634 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 SMOXQ9NWM0 555 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 CPNE7Q9UBL6 633 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ADAM28Q9UKQ2 775 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 MYH2Q9UKX2 1941 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 ATP8B3O60423 1300 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TRAV3A0A0B4J244 114 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-35P-201ENST00000384530 TRAV40A0A0B4J280 105 aa-0.3□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms