RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GALPQ9UBC7 116 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAFFQ9ULX9 164 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 USP22Q9UPT9 525 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PRELID1Q9Y255 219 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MEIOCA2RUB1 952 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KRT87PA6NCN2 255 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 A8MU76 341 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HHLA1C9JL84 531 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 E9PQ18 207 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 F8W810 466 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PROM1O43490 865 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ULK1O75385 1050 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EFEMP2O95967 443 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LCKP06239 509 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PFKLP17858 780 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-FP30511 346 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CA5AP35218 305 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GGT2P36268 569 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LIPAP38571 399 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RGS4P49798 205 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.32e-7■■■□□ 16
CTPS1-201ENST00000372616 ASAH1Q13510 395 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LAPTM5Q13571 262 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GBX1Q14549 363 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TAB1Q15750 504 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC58Q4VC31 144 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TPGS2Q68CL5 300 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC66Q68CR7 880 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CPA6Q8N4T0 437 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EFHBQ8N7U6 833 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HERVK_113Q902F9 699 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TESCQ96BS2 214 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ACTL8Q9H568 366 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C12orf10Q9HB07 376 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ING3Q9NXR8 418 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NUP50Q9UKX7 468 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 U3KQV3 271 aa6.92□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DSCR3O14972 297 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ABLIM3O94929 683 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF682O95780 498 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PEX11BO96011 259 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ALPPP05187 535 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 URODP06132 367 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EBLN1P0CF75 366 aa6.91□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NID1P14543 1247 aa6.91□□□□□ -1.3
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