RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 VEPH1Q14D04 833 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 BCL7AQ4VC05 210 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 IER5LQ5T953 404 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 KLHL17Q6TDP4 642 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 AUTS2Q8WXX7 1259 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 NEDD4LQ96PU5 975 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TPK1Q9H3S4 243 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 THSD1Q9NS62 852 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 SLCO2B1O94956 709 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 IMPA1P29218 277 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TEKQ02763 1124 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 SPANXN2Q5MJ10 180 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 AGAP6Q5VW22 663 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 RNF130Q86XS8 419 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CMTM8Q8IZV2 173 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 AQP11Q8NBQ7 271 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CHAC2Q8WUX2 184 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 AGAP4Q96P64 663 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 OPALINQ96PE5 141 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TAPBPLQ9BX59 468 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CDCA4Q9BXL8 241 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 BRF2Q9HAW0 419 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 C1GALT1Q9NS00 363 aa18.01■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CYP7B1O75881 506 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CCNKO75909 580 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 KLHL18O94889 574 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 GASTP01350 101 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CHMP24386 653 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 HLA-FP30511 346 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CNR2P34972 360 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 HNF4AP41235 474 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TGM4P49221 684 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 ZNF33BQ06732 778 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 LRRC26Q2I0M4 334 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 LEXMQ3ZCV2 418 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 ZMAT1Q5H9K5 638 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 FAM180BQ6P0A1 224 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 ARMCX6Q7L4S7 300 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 SLC43A3Q8NBI5 491 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 NEIL2Q969S2 332 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CRELD1Q96HD1 420 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 IGSF21Q96ID5 467 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PKP4Q99569 1192 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 BARHL1Q9BZE3 327 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 STARD7Q9NQZ5 370 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 KIAA1671Q9BY89 1806 aa18■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 FADS2P1A8MWK0 482 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 NPC1O15118 1278 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TSPAN6O43657 245 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 SOX3P41225 446 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TM4SF4P48230 202 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CTSCP53634 463 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 SLC5A12Q1EHB4 618 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 OR52N2Q8NGI0 321 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 WDR48Q8TAF3 677 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 FIBINQ8TAL6 211 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.474e-15■■■□□ 18.4
CITED2-201ENST00000367651 ASZ1Q8WWH4 475 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 LMLNQ96KR4 655 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 OR2A14Q96R47 310 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 YME1L1Q96TA2 773 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PIP5K1AQ99755 562 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 MKLN1Q9UL63 735 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 DOCK6Q96HP0 2047 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 ZAR1LA6NP61 321 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 HSD3B1P14060 373 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 HSD3B2P26439 372 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 POU1F1P28069 291 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TNFSF8P32971 234 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 OLR1P78380 273 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 Q6ZVL8 140 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 Q6ZVU0 165 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 NRARPQ7Z6K4 114 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TMPRSS11BQ86T26 416 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 MMP21Q8N119 569 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 IL4I1Q96RQ9 567 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CNPPD1Q9BV87 410 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 HHATLQ9HCP6 504 aa17.99■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CLEC2DQ9UHP7 191 aa17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms