RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 LMX1BO60663 402 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSF2BPO75031 334 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 MT-ATP6P00846 226 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TGFAP01135 160 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 EPOP01588 193 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTMAP06454 111 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PGK2P07205 417 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CT45A8P0DMV1 189 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CT45A9P0DMV2 189 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC192P0DO97 292 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ETS1P14921 441 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 B4GALT1P15291 398 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF18P17022 549 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 AADACP22760 399 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACKR3P25106 362 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPA1P27694 616 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC1A3P43003 542 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PITPNBP48739 271 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 EVCP57679 992 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNJ10P78508 379 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHEXP78562 749 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 HTD2P86397 168 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GUCY2DQ02846 1103 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GABPAQ06546 454 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNTN1Q12860 1018 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPHARQ15513 63 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CT45A2Q5DJT8 189 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 STPG1Q5TH74 334 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 C12orf60Q5U649 245 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 WDR88Q6ZMY6 472 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC43A2Q8N370 569 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DCLK2Q8N568 766 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TEX9Q8N6V9 391 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC185Q8N715 623 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCEANCQ8N8B7 351 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 C9orf106Q8NAJ2 232 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM178AQ8NBL3 297 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR10V1Q8NGI7 309 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBTD2Q8WUN7 234 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GLYATL1Q969I3 302 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRAC1Q96KF2 57 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SAMD8Q96LT4 415 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 NSMCE2Q96MF7 247 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 UHRF2Q96PU4 802 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNK16Q96T55 309 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHB18PQ96TA0 734 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 S1PR3Q99500 378 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 IL12RB2Q99665 862 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SSX3Q99909 188 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBAC1Q9BSL1 405 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 NYXQ9GZU5 481 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF665Q9H7R5 613 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DCLRE1BQ9H816 532 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 VIPAS39Q9H9C1 493 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACOXLQ9NUZ1 547 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLKQ9UBT6 870 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 POMT2Q9UKY4 750 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 EXOC7Q9UPT5 735 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 C2CD2Q9Y426 696 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 NEDD4P46934 1319 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 UMODL1Q5DID0 1318 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A087WW49 117 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PR80 420 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 RGSL1A5PLK6 1076 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 GLTPD2A6NH11 291 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 KPNA7A9QM74 516 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 LMO7DNF2Z398 122 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM72CH0Y354 149 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC1A7O00341 560 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TXNL1O43396 289 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDH7O60245 1069 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRP3O75074 770 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP6V1G1O75348 118 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRCH4O75427 683 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM16O95361 564 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 CPNE6O95741 557 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGLV2-11P01706 119 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SFTPBP07988 381 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 SERPINF2P08697 491 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-655P-201ENST00000362858 PATE4P0C8F1 98 aa2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms