RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333467.3

APOBEC3B-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3B, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-201ENST00000333467 UGT1A4P22310 534 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 UGT1A3P35503 534 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CAPGP40121 348 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 EPHA4P54764 986 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 SQSTM1Q13501 440 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TGFBIQ15582 683 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TGIF1Q15583 401 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CYP51A1Q16850 503 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZBED5Q49AG3 693 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 GPRC6AQ5T6X5 926 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 GPR141Q7Z602 305 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 SPPL2CQ8IUH8 684 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CBR4Q8N4T8 237 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 DHRSXQ8N5I4 330 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 AVL9Q8NBF6 648 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 UBTD2Q8WUN7 234 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 USP7Q93009 1102 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZBTB18Q99592 522 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 DPYSL5Q9BPU6 564 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 BTRCQ9Y297 605 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR2AG2A6NM03 316 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR52A4PA6NMU1 304 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 ETS2P15036 469 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CHRM3P20309 590 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 AKT1P31749 480 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CLCN7P51798 805 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 RPS6KA3P51812 740 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CTSCP53634 463 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 DIO3P55073 304 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 RAB15P59190 212 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 VAC14Q08AM6 782 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 PWP1Q13610 501 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CTSL3PQ5NE16 218 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 SNAP47Q5SQN1 464 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 LDLRAP1Q5SW96 308 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 NANOGP8Q6NSW7 305 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM71Q6P5X7 295 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 FAM129CQ86XR2 697 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TRIM48Q8IWZ4 208 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 FAM47BQ8NA70 645 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 FNDC5Q8NAU1 212 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 AGBL5Q8NDL9 886 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 SH3KBP1Q96B97 665 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 KCNA7Q96RP8 456 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 UGT2B28Q9BY64 529 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 NANOGQ9H9S0 305 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 FKBPLQ9UIM3 349 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 OARD1Q9Y530 152 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 GMEB1Q9Y692 573 aa10.63□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 A8MU76 341 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 K7ENP7 123 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 PPP6CO00743 305 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 RGS14O43566 566 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 PRSS23O95084 383 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 VIPP01282 170 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CBSLP0DN79 551 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 RAP2AP10114 183 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 IL1RNP18510 177 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CBSP35520 551 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 GFERP55789 205 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 GK3PQ14409 553 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TTLL9Q3SXZ7 439 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 GPR33Q49SQ1 333 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 SULT1C3Q6IMI6 304 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 DET1Q7L5Y6 550 aa10.62□□□□□ -0.71
APOBEC3B-201ENST00000333467 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms