RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 SLC13A2Q13183 592 aa21.8■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM54-201ENST00000329151 KLHL31Q9H511 634 aa21.8■■□□□ 1.08
TMEM54-201ENST00000329151 NECTIN3Q9NQS3 549 aa21.8■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 C3P1Q6ZMU1 363 aa21.79■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 CA13Q8N1Q1 262 aa21.79■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TMEM54-201ENST00000329151 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa21.79■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 OARD1Q9Y530 152 aa21.79■■□□□ 1.08
TMEM54-201ENST00000329151 TACC2O95359 2948 aa21.79■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM54-201ENST00000329151 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM54-201ENST00000329151 USP27XA6NNY8 438 aa21.78■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa21.78■■□□□ 1.08
TMEM54-201ENST00000329151 DOLPP1Q86YN1 238 aa21.78■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 TGM3Q08188 693 aa21.77■■□□□ 1.08
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TMEM54-201ENST00000329151 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM54-201ENST00000329151 TEX264Q9Y6I9 313 aa21.77■■□□□ 1.08
TMEM54-201ENST00000329151 F8P00451 2351 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 A0A0G2JN53 185 aa21.76■■□□□ 1.07
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TMEM54-201ENST00000329151 CLGNO14967 610 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 ZNHIT1O43257 154 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 ITGA10O75578 1167 aa21.76■■□□□ 1.07
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TMEM54-201ENST00000329151 IFNA16P05015 189 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 SMIM10L1P0DMW3 83 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 PTGER1P34995 402 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 RFC3P40938 356 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 HSD17B7P56937 341 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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TMEM54-201ENST00000329151 ZNF460Q14592 562 aa21.76■■□□□ 1.07
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TMEM54-201ENST00000329151 PAOXQ6QHF9 649 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 DCHS2Q6V1P9 2916 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 SULF2Q8IWU5 870 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 CREB3L4Q8TEY5 395 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 SMIM10Q96HG1 83 aa21.76■■□□□ 1.07
TMEM54-201ENST00000329151 PWWP2AQ96N64 755 aa21.76■■□□□ 1.07
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